Вслед за основными историями из оригинального комикса, Люди Икс: Эволюция рассказывает жизнь шести мутантов (Циклопа, Джины Грей, Ночного Змея, Призрачной Кошки, Шельмы и нового оригинального персонажа по имени Шип), которые посещают школу Профессора Икс для Одарённых, где они должны научиться контролировать свои силы и использовать их во благо. Эти подростки должны столкнуться с миром, который и боится, и презирает их, но именно им предстоит его спасти.

Список серий:
01. Стратегия Икс
02. Икс-Импульс
03. Вербовка Роуг
04. Влюбленный мутант
05. Шип и скорость
06. Срединный мир
07. Возвращение Роуг
08. Острая камера
09. Выживает сильнейший
10. Тёмное прошлое
11. Мрачное напоминание
12-13. Плавильный котёл