Спустя десять лет после вторжения в Набу, галактика находится на грани гражданской войны. Под руководством джедая-отступника по имени граф Дуку, тысячи солнечных систем угрожают отделиться от Галактической Республики. После покушение на убийство сенатора Падме Амидалу, бывшей королевы Набу, 19 летний ученик джедая Энакин Скайуокер назначен для её защиты. В ходе своей миссии Энакин обнаруживает свою любовь к Падме, а также к своей собственной тёмной стороне. Вскоре Энакин, Падме и Оби-Ван Кеноби втянуты в сердце сепаратистского движения и начала Войны клонов.