Действие мультсериала происходят во вселенной «Звёздных войн», между событиями второго и третьего киноэпизодов. В сериале описываются войны клонов между Республикой и Конфедерацией графа Дуку.

Было снято по десять трёхминутных серий первого и второго сезона, а также пять 12-15 минутных серий третьего сезона. Впоследствии первый и второй сезон были объединены в Том 1, а третий сезон в Том 2.